Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPN13Q12923 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN13Q12923 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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