Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGEF5Q12774 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARHGEF5Q12774 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms