Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CYP4F3Q08477 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms