Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNB2Q08289 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms