Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SOS1Q07889 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOS1Q07889 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms