Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms