Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHRNEQ04844 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms