Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NHLH2Q02577 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms