Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
XPCQ01831 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
XPCQ01831 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
XPCQ01831 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
XPCQ01831 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
XPCQ01831 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
XPCQ01831 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
XPCQ01831 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
XPCQ01831 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
XPCQ01831 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
XPCQ01831 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
XPCQ01831 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
XPCQ01831 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
XPCQ01831 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
XPCQ01831 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
XPCQ01831 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
XPCQ01831 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
XPCQ01831 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
XPCQ01831 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
XPCQ01831 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
XPCQ01831 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
XPCQ01831 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
XPCQ01831 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
XPCQ01831 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
XPCQ01831 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
XPCQ01831 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
XPCQ01831 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
XPCQ01831 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
XPCQ01831 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
XPCQ01831 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
XPCQ01831 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
XPCQ01831 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
XPCQ01831 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
XPCQ01831 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
XPCQ01831 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
XPCQ01831 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
XPCQ01831 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
XPCQ01831 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
XPCQ01831 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
XPCQ01831 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
XPCQ01831 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
XPCQ01831 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XPCQ01831 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XPCQ01831 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XPCQ01831 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
XPCQ01831 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
XPCQ01831 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
XPCQ01831 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
XPCQ01831 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
XPCQ01831 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
XPCQ01831 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
XPCQ01831 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XPCQ01831 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XPCQ01831 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XPCQ01831 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XPCQ01831 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XPCQ01831 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XPCQ01831 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XPCQ01831 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
XPCQ01831 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
XPCQ01831 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
XPCQ01831 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
XPCQ01831 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
XPCQ01831 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
XPCQ01831 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
XPCQ01831 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
XPCQ01831 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
XPCQ01831 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
XPCQ01831 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
XPCQ01831 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
XPCQ01831 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
XPCQ01831 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
XPCQ01831 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
XPCQ01831 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
XPCQ01831 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
XPCQ01831 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
XPCQ01831 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
XPCQ01831 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
XPCQ01831 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
XPCQ01831 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
XPCQ01831 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
XPCQ01831 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
XPCQ01831 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
XPCQ01831 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
XPCQ01831 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
XPCQ01831 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
XPCQ01831 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
XPCQ01831 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
XPCQ01831 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
XPCQ01831 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
XPCQ01831 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
XPCQ01831 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
XPCQ01831 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
XPCQ01831 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
XPCQ01831 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
XPCQ01831 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
XPCQ01831 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
XPCQ01831 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
XPCQ01831 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
XPCQ01831 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms