Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLF3P57682 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF3P57682 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF3P57682 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF3P57682 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF3P57682 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF3P57682 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF3P57682 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF3P57682 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF3P57682 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF3P57682 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF3P57682 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF3P57682 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF3P57682 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF3P57682 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF3P57682 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF3P57682 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF3P57682 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF3P57682 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF3P57682 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF3P57682 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF3P57682 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF3P57682 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF3P57682 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF3P57682 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF3P57682 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF3P57682 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF3P57682 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF3P57682 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF3P57682 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF3P57682 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF3P57682 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF3P57682 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF3P57682 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF3P57682 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF3P57682 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF3P57682 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF3P57682 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF3P57682 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF3P57682 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF3P57682 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF3P57682 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF3P57682 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF3P57682 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
KLF3P57682 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
KLF3P57682 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF3P57682 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF3P57682 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF3P57682 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF3P57682 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF3P57682 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF3P57682 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF3P57682 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF3P57682 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF3P57682 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF3P57682 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF3P57682 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF3P57682 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF3P57682 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF3P57682 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF3P57682 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF3P57682 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF3P57682 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF3P57682 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF3P57682 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF3P57682 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF3P57682 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF3P57682 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF3P57682 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF3P57682 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF3P57682 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF3P57682 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF3P57682 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF3P57682 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF3P57682 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF3P57682 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF3P57682 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF3P57682 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF3P57682 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF3P57682 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF3P57682 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF3P57682 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF3P57682 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF3P57682 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF3P57682 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF3P57682 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF3P57682 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF3P57682 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF3P57682 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF3P57682 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF3P57682 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF3P57682 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF3P57682 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF3P57682 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF3P57682 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF3P57682 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF3P57682 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF3P57682 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF3P57682 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF3P57682 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms