Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME5P56597 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME5P56597 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME5P56597 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME5P56597 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME5P56597 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME5P56597 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME5P56597 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME5P56597 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME5P56597 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME5P56597 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME5P56597 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME5P56597 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME5P56597 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME5P56597 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME5P56597 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME5P56597 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NME5P56597 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME5P56597 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME5P56597 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME5P56597 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NME5P56597 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NME5P56597 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME5P56597 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME5P56597 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME5P56597 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME5P56597 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME5P56597 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME5P56597 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME5P56597 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME5P56597 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME5P56597 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME5P56597 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME5P56597 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME5P56597 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME5P56597 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME5P56597 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME5P56597 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME5P56597 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME5P56597 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NME5P56597 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME5P56597 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME5P56597 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME5P56597 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME5P56597 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME5P56597 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME5P56597 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME5P56597 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME5P56597 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME5P56597 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME5P56597 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME5P56597 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME5P56597 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME5P56597 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NME5P56597 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME5P56597 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME5P56597 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME5P56597 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME5P56597 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME5P56597 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME5P56597 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME5P56597 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME5P56597 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME5P56597 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME5P56597 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME5P56597 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME5P56597 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME5P56597 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME5P56597 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME5P56597 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME5P56597 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME5P56597 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NME5P56597 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME5P56597 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME5P56597 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME5P56597 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME5P56597 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME5P56597 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NME5P56597 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME5P56597 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME5P56597 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME5P56597 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME5P56597 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME5P56597 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME5P56597 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME5P56597 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME5P56597 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME5P56597 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME5P56597 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME5P56597 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME5P56597 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME5P56597 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME5P56597 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME5P56597 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME5P56597 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME5P56597 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME5P56597 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME5P56597 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME5P56597 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NME5P56597 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms