Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNA2D1P54289 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms