Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRAP54198 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRAP54198 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRAP54198 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRAP54198 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRAP54198 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRAP54198 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIRAP54198 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIRAP54198 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIRAP54198 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIRAP54198 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIRAP54198 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIRAP54198 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIRAP54198 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIRAP54198 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIRAP54198 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIRAP54198 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIRAP54198 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIRAP54198 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HIRAP54198 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HIRAP54198 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIRAP54198 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIRAP54198 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HIRAP54198 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HIRAP54198 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIRAP54198 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIRAP54198 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIRAP54198 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIRAP54198 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HIRAP54198 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIRAP54198 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIRAP54198 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIRAP54198 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIRAP54198 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIRAP54198 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIRAP54198 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIRAP54198 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIRAP54198 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIRAP54198 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIRAP54198 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIRAP54198 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIRAP54198 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIRAP54198 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIRAP54198 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIRAP54198 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIRAP54198 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIRAP54198 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRAP54198 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRAP54198 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRAP54198 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRAP54198 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRAP54198 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRAP54198 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRAP54198 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRAP54198 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRAP54198 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRAP54198 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRAP54198 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRAP54198 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRAP54198 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRAP54198 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRAP54198 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRAP54198 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRAP54198 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRAP54198 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRAP54198 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRAP54198 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRAP54198 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRAP54198 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRAP54198 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRAP54198 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIRAP54198 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIRAP54198 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIRAP54198 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIRAP54198 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HIRAP54198 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIRAP54198 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIRAP54198 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HIRAP54198 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIRAP54198 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIRAP54198 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIRAP54198 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIRAP54198 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIRAP54198 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIRAP54198 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIRAP54198 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIRAP54198 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIRAP54198 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIRAP54198 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIRAP54198 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIRAP54198 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIRAP54198 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIRAP54198 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIRAP54198 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIRAP54198 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIRAP54198 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HIRAP54198 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIRAP54198 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIRAP54198 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIRAP54198 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms