Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF6P49848 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF6P49848 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF6P49848 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF6P49848 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF6P49848 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF6P49848 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF6P49848 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF6P49848 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF6P49848 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF6P49848 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF6P49848 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF6P49848 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF6P49848 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF6P49848 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF6P49848 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF6P49848 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF6P49848 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF6P49848 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF6P49848 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF6P49848 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF6P49848 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF6P49848 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF6P49848 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF6P49848 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF6P49848 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF6P49848 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF6P49848 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF6P49848 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF6P49848 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TAF6P49848 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TAF6P49848 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TAF6P49848 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TAF6P49848 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TAF6P49848 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TAF6P49848 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TAF6P49848 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TAF6P49848 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TAF6P49848 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TAF6P49848 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TAF6P49848 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TAF6P49848 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF6P49848 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF6P49848 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF6P49848 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF6P49848 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF6P49848 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF6P49848 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF6P49848 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF6P49848 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF6P49848 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF6P49848 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF6P49848 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF6P49848 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF6P49848 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF6P49848 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF6P49848 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF6P49848 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF6P49848 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF6P49848 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF6P49848 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF6P49848 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF6P49848 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF6P49848 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF6P49848 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF6P49848 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF6P49848 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF6P49848 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF6P49848 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF6P49848 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF6P49848 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF6P49848 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF6P49848 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF6P49848 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF6P49848 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF6P49848 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF6P49848 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF6P49848 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF6P49848 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF6P49848 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF6P49848 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF6P49848 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF6P49848 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF6P49848 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF6P49848 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF6P49848 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF6P49848 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF6P49848 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF6P49848 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF6P49848 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF6P49848 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF6P49848 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF6P49848 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF6P49848 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF6P49848 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF6P49848 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF6P49848 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF6P49848 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF6P49848 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF6P49848 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms