Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POU3F4P49335 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POU3F4P49335 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms