Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPARGP37231 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPARGP37231 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPARGP37231 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPARGP37231 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPARGP37231 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPARGP37231 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPARGP37231 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPARGP37231 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPARGP37231 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PPARGP37231 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPARGP37231 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPARGP37231 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPARGP37231 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPARGP37231 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPARGP37231 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPARGP37231 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPARGP37231 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPARGP37231 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPARGP37231 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPARGP37231 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPARGP37231 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPARGP37231 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPARGP37231 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPARGP37231 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPARGP37231 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPARGP37231 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPARGP37231 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPARGP37231 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPARGP37231 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPARGP37231 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPARGP37231 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPARGP37231 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PPARGP37231 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PPARGP37231 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PPARGP37231 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PPARGP37231 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPARGP37231 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PPARGP37231 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPARGP37231 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPARGP37231 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPARGP37231 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PPARGP37231 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPARGP37231 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPARGP37231 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPARGP37231 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPARGP37231 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPARGP37231 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPARGP37231 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPARGP37231 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPARGP37231 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPARGP37231 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPARGP37231 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPARGP37231 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPARGP37231 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPARGP37231 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PPARGP37231 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPARGP37231 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPARGP37231 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPARGP37231 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPARGP37231 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPARGP37231 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPARGP37231 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPARGP37231 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPARGP37231 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPARGP37231 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPARGP37231 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPARGP37231 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPARGP37231 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PPARGP37231 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPARGP37231 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPARGP37231 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPARGP37231 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPARGP37231 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPARGP37231 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPARGP37231 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPARGP37231 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PPARGP37231 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPARGP37231 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPARGP37231 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPARGP37231 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPARGP37231 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPARGP37231 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPARGP37231 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPARGP37231 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPARGP37231 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPARGP37231 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPARGP37231 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPARGP37231 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPARGP37231 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPARGP37231 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPARGP37231 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPARGP37231 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPARGP37231 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPARGP37231 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPARGP37231 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPARGP37231 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPARGP37231 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPARGP37231 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPARGP37231 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms