Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP7BP35670 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms