Protein–RNA interactions for Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4AP35499 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN4AP35499 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms