Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA4P35212 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA4P35212 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA4P35212 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA4P35212 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA4P35212 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA4P35212 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA4P35212 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA4P35212 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA4P35212 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA4P35212 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA4P35212 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA4P35212 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA4P35212 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA4P35212 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA4P35212 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA4P35212 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA4P35212 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA4P35212 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA4P35212 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA4P35212 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA4P35212 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA4P35212 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA4P35212 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA4P35212 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA4P35212 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA4P35212 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA4P35212 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJA4P35212 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJA4P35212 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJA4P35212 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJA4P35212 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJA4P35212 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJA4P35212 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJA4P35212 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJA4P35212 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJA4P35212 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJA4P35212 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJA4P35212 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJA4P35212 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJA4P35212 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJA4P35212 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJA4P35212 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJA4P35212 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJA4P35212 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJA4P35212 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJA4P35212 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJA4P35212 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJA4P35212 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJA4P35212 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJA4P35212 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJA4P35212 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GJA4P35212 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJA4P35212 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJA4P35212 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJA4P35212 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJA4P35212 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJA4P35212 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJA4P35212 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJA4P35212 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJA4P35212 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJA4P35212 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJA4P35212 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJA4P35212 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJA4P35212 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJA4P35212 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJA4P35212 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJA4P35212 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA4P35212 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA4P35212 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA4P35212 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA4P35212 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA4P35212 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA4P35212 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA4P35212 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA4P35212 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA4P35212 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA4P35212 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA4P35212 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA4P35212 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA4P35212 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA4P35212 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA4P35212 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA4P35212 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA4P35212 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA4P35212 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA4P35212 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA4P35212 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA4P35212 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA4P35212 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA4P35212 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA4P35212 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA4P35212 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA4P35212 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA4P35212 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA4P35212 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA4P35212 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA4P35212 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA4P35212 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA4P35212 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms