Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms