Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA9P31269 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA9P31269 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA9P31269 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA9P31269 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA9P31269 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA9P31269 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA9P31269 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA9P31269 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA9P31269 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXA9P31269 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXA9P31269 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXA9P31269 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXA9P31269 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXA9P31269 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA9P31269 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms