Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA3P26006 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA3P26006 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms