Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL3P19876 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms