Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DSPP15924 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSPP15924 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSPP15924 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSPP15924 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSPP15924 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSPP15924 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSPP15924 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSPP15924 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSPP15924 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSPP15924 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSPP15924 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSPP15924 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSPP15924 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSPP15924 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSPP15924 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSPP15924 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSPP15924 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSPP15924 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSPP15924 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DSPP15924 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DSPP15924 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSPP15924 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSPP15924 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSPP15924 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSPP15924 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DSPP15924 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DSPP15924 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DSPP15924 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSPP15924 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSPP15924 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSPP15924 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSPP15924 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSPP15924 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSPP15924 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DSPP15924 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSPP15924 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSPP15924 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSPP15924 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSPP15924 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSPP15924 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSPP15924 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSPP15924 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSPP15924 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSPP15924 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DSPP15924 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSPP15924 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSPP15924 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSPP15924 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSPP15924 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSPP15924 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSPP15924 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSPP15924 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSPP15924 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSPP15924 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSPP15924 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSPP15924 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSPP15924 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSPP15924 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSPP15924 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSPP15924 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSPP15924 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSPP15924 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSPP15924 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSPP15924 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSPP15924 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSPP15924 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
DSPP15924 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSPP15924 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DSPP15924 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSPP15924 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSPP15924 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSPP15924 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSPP15924 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSPP15924 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSPP15924 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSPP15924 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSPP15924 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DSPP15924 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSPP15924 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DSPP15924 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSPP15924 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSPP15924 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSPP15924 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DSPP15924 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DSPP15924 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSPP15924 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSPP15924 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSPP15924 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSPP15924 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSPP15924 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSPP15924 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
DSPP15924 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
DSPP15924 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DSPP15924 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DSPP15924 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
DSPP15924 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSPP15924 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSPP15924 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSPP15924 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms