Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD46P15529 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD46P15529 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD46P15529 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD46P15529 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD46P15529 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD46P15529 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD46P15529 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD46P15529 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD46P15529 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD46P15529 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD46P15529 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD46P15529 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD46P15529 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD46P15529 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD46P15529 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD46P15529 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD46P15529 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD46P15529 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD46P15529 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD46P15529 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD46P15529 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD46P15529 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD46P15529 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD46P15529 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD46P15529 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CD46P15529 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CD46P15529 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD46P15529 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD46P15529 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD46P15529 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD46P15529 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD46P15529 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD46P15529 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD46P15529 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD46P15529 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD46P15529 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD46P15529 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD46P15529 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CD46P15529 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CD46P15529 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CD46P15529 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CD46P15529 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CD46P15529 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CD46P15529 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD46P15529 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD46P15529 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD46P15529 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CD46P15529 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD46P15529 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD46P15529 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD46P15529 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD46P15529 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD46P15529 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD46P15529 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD46P15529 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD46P15529 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD46P15529 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD46P15529 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CD46P15529 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CD46P15529 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD46P15529 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD46P15529 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CD46P15529 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD46P15529 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD46P15529 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD46P15529 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD46P15529 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD46P15529 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD46P15529 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CD46P15529 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD46P15529 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CD46P15529 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD46P15529 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CD46P15529 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD46P15529 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD46P15529 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD46P15529 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD46P15529 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD46P15529 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD46P15529 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD46P15529 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD46P15529 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD46P15529 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD46P15529 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD46P15529 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD46P15529 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD46P15529 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD46P15529 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD46P15529 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD46P15529 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD46P15529 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD46P15529 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD46P15529 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD46P15529 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD46P15529 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD46P15529 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD46P15529 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD46P15529 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD46P15529 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms