Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPA1P15085 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPA1P15085 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPA1P15085 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPA1P15085 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPA1P15085 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPA1P15085 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPA1P15085 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CPA1P15085 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPA1P15085 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPA1P15085 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPA1P15085 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPA1P15085 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPA1P15085 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPA1P15085 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPA1P15085 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPA1P15085 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA1P15085 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA1P15085 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA1P15085 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA1P15085 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA1P15085 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA1P15085 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA1P15085 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA1P15085 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA1P15085 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA1P15085 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA1P15085 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA1P15085 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA1P15085 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA1P15085 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA1P15085 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA1P15085 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA1P15085 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA1P15085 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA1P15085 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA1P15085 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA1P15085 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA1P15085 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA1P15085 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA1P15085 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA1P15085 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA1P15085 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA1P15085 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA1P15085 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA1P15085 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA1P15085 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPA1P15085 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPA1P15085 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPA1P15085 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPA1P15085 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPA1P15085 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPA1P15085 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPA1P15085 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPA1P15085 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPA1P15085 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPA1P15085 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPA1P15085 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPA1P15085 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPA1P15085 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPA1P15085 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CPA1P15085 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPA1P15085 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPA1P15085 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPA1P15085 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPA1P15085 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPA1P15085 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPA1P15085 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA1P15085 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA1P15085 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA1P15085 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA1P15085 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA1P15085 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA1P15085 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA1P15085 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA1P15085 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA1P15085 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA1P15085 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA1P15085 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA1P15085 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA1P15085 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA1P15085 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA1P15085 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA1P15085 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA1P15085 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA1P15085 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA1P15085 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA1P15085 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA1P15085 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA1P15085 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA1P15085 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA1P15085 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA1P15085 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA1P15085 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA1P15085 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA1P15085 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA1P15085 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA1P15085 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA1P15085 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA1P15085 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms