Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MS4A1P11836 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms