Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNB1P11230 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms