Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GLI3P10071 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GLI3P10071 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GLI3P10071 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GLI3P10071 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GLI3P10071 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GLI3P10071 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GLI3P10071 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GLI3P10071 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GLI3P10071 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GLI3P10071 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GLI3P10071 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GLI3P10071 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GLI3P10071 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GLI3P10071 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GLI3P10071 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GLI3P10071 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GLI3P10071 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GLI3P10071 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GLI3P10071 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GLI3P10071 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GLI3P10071 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GLI3P10071 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GLI3P10071 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GLI3P10071 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GLI3P10071 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GLI3P10071 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GLI3P10071 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GLI3P10071 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GLI3P10071 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GLI3P10071 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GLI3P10071 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GLI3P10071 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GLI3P10071 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GLI3P10071 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GLI3P10071 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GLI3P10071 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GLI3P10071 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GLI3P10071 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GLI3P10071 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GLI3P10071 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GLI3P10071 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GLI3P10071 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GLI3P10071 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GLI3P10071 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GLI3P10071 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GLI3P10071 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GLI3P10071 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GLI3P10071 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GLI3P10071 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GLI3P10071 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GLI3P10071 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GLI3P10071 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GLI3P10071 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GLI3P10071 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GLI3P10071 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GLI3P10071 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GLI3P10071 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GLI3P10071 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GLI3P10071 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GLI3P10071 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GLI3P10071 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GLI3P10071 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GLI3P10071 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GLI3P10071 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GLI3P10071 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GLI3P10071 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GLI3P10071 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GLI3P10071 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GLI3P10071 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GLI3P10071 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GLI3P10071 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GLI3P10071 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GLI3P10071 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GLI3P10071 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GLI3P10071 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GLI3P10071 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GLI3P10071 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GLI3P10071 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GLI3P10071 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GLI3P10071 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GLI3P10071 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GLI3P10071 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GLI3P10071 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GLI3P10071 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GLI3P10071 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GLI3P10071 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GLI3P10071 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GLI3P10071 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GLI3P10071 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GLI3P10071 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GLI3P10071 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GLI3P10071 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GLI3P10071 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GLI3P10071 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GLI3P10071 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GLI3P10071 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GLI3P10071 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GLI3P10071 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GLI3P10071 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms