Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CT47B1P0C2W7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms