Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POP4O95707 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POP4O95707 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POP4O95707 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POP4O95707 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POP4O95707 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POP4O95707 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POP4O95707 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POP4O95707 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POP4O95707 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POP4O95707 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POP4O95707 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POP4O95707 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POP4O95707 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POP4O95707 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POP4O95707 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POP4O95707 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POP4O95707 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POP4O95707 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POP4O95707 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
POP4O95707 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POP4O95707 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POP4O95707 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POP4O95707 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
POP4O95707 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POP4O95707 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
POP4O95707 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POP4O95707 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POP4O95707 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POP4O95707 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POP4O95707 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POP4O95707 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POP4O95707 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POP4O95707 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POP4O95707 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POP4O95707 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POP4O95707 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POP4O95707 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POP4O95707 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POP4O95707 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POP4O95707 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POP4O95707 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POP4O95707 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POP4O95707 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POP4O95707 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POP4O95707 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POP4O95707 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POP4O95707 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POP4O95707 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POP4O95707 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POP4O95707 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POP4O95707 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POP4O95707 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POP4O95707 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POP4O95707 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POP4O95707 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POP4O95707 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POP4O95707 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POP4O95707 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POP4O95707 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POP4O95707 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POP4O95707 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POP4O95707 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POP4O95707 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POP4O95707 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POP4O95707 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POP4O95707 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POP4O95707 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POP4O95707 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POP4O95707 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POP4O95707 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POP4O95707 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POP4O95707 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POP4O95707 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POP4O95707 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POP4O95707 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POP4O95707 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POP4O95707 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POP4O95707 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POP4O95707 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POP4O95707 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POP4O95707 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POP4O95707 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POP4O95707 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POP4O95707 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POP4O95707 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
POP4O95707 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
POP4O95707 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
POP4O95707 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
POP4O95707 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
POP4O95707 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POP4O95707 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POP4O95707 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POP4O95707 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POP4O95707 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POP4O95707 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POP4O95707 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POP4O95707 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POP4O95707 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POP4O95707 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms