Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms