Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCA5O60264 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCA5O60264 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms