Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
HTATSF1O43719 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms