Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA2O43364 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms