Protein–RNA interactions for Protein: O15015

ZNF646, Zinc finger protein 646, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF646O15015 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF646O15015 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF646O15015 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF646O15015 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF646O15015 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF646O15015 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF646O15015 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF646O15015 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF646O15015 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF646O15015 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF646O15015 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF646O15015 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF646O15015 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF646O15015 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF646O15015 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF646O15015 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF646O15015 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms