Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ODF3BA8MYP8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF3BA8MYP8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms