Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA3AA6NCI4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms