Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC144AA2RUR9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC144AA2RUR9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC144AA2RUR9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC144AA2RUR9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC144AA2RUR9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC144AA2RUR9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC144AA2RUR9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC144AA2RUR9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC144AA2RUR9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC144AA2RUR9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC144AA2RUR9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC144AA2RUR9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC144AA2RUR9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC144AA2RUR9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC144AA2RUR9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC144AA2RUR9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC144AA2RUR9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC144AA2RUR9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC144AA2RUR9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC144AA2RUR9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC144AA2RUR9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC144AA2RUR9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC144AA2RUR9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC144AA2RUR9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC144AA2RUR9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC144AA2RUR9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC144AA2RUR9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CCDC144AA2RUR9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC144AA2RUR9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC144AA2RUR9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC144AA2RUR9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC144AA2RUR9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC144AA2RUR9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC144AA2RUR9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC144AA2RUR9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC144AA2RUR9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC144AA2RUR9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC144AA2RUR9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC144AA2RUR9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC144AA2RUR9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC144AA2RUR9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC144AA2RUR9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC144AA2RUR9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC144AA2RUR9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC144AA2RUR9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC144AA2RUR9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC144AA2RUR9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC144AA2RUR9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC144AA2RUR9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms