Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1043P-201ENST00000410355 99 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-854P-201ENST00000364036 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR548AH-201ENST00000637109 76 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR124-1-201ENST00000385275 85 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 213.9 ms