Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KRTAP9-9Q9BYP9 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KRTAP9-9Q9BYP9 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
KRTAP9-9Q9BYP9 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
KRTAP9-9Q9BYP9 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KRTAP9-9Q9BYP9 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP9-9Q9BYP9 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP9-9Q9BYP9 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP9-9Q9BYP9 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP9-9Q9BYP9 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP9-9Q9BYP9 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP9-9Q9BYP9 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR548AH-201ENST00000637109 76 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KRTAP9-9Q9BYP9 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-1161P-201ENST00000516176 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP9-9Q9BYP9 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 313.8 ms