Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NFX1Q12986 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
NFX1Q12986 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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