Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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KRTAP9-3Q9BYQ3 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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KRTAP9-3Q9BYQ3 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
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KRTAP9-3Q9BYQ3 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
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KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
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KRTAP9-3Q9BYQ3 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
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