Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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FOXD1Q16676 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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FOXD1Q16676 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXD1Q16676 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXD1Q16676 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXD1Q16676 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXD1Q16676 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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FOXD1Q16676 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXD1Q16676 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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FOXD1Q16676 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
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FOXD1Q16676 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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FOXD1Q16676 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD1Q16676 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD1Q16676 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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FOXD1Q16676 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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FOXD1Q16676 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FOXD1Q16676 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
FOXD1Q16676 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
FOXD1Q16676 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
FOXD1Q16676 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
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FOXD1Q16676 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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FOXD1Q16676 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXD1Q16676 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
FOXD1Q16676 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
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FOXD1Q16676 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD1Q16676 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
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FOXD1Q16676 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXD1Q16676 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
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FOXD1Q16676 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXD1Q16676 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
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FOXD1Q16676 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXD1Q16676 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXD1Q16676 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXD1Q16676 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXD1Q16676 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXD1Q16676 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXD1Q16676 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXD1Q16676 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
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FOXD1Q16676 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXD1Q16676 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXD1Q16676 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXD1Q16676 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXD1Q16676 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXD1Q16676 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXD1Q16676 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXD1Q16676 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXD1Q16676 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXD1Q16676 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXD1Q16676 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXD1Q16676 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXD1Q16676 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
FOXD1Q16676 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXD1Q16676 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXD1Q16676 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXD1Q16676 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXD1Q16676 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
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