Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
TCOF1Q13428 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC-2.07□□□□□ -2.74
TCOF1Q13428 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
TCOF1Q13428 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
TCOF1Q13428 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
TCOF1Q13428 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
TCOF1Q13428 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
TCOF1Q13428 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
TCOF1Q13428 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
TCOF1Q13428 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
TCOF1Q13428 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
TCOF1Q13428 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
TCOF1Q13428 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
TCOF1Q13428 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
TCOF1Q13428 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
TCOF1Q13428 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC-2.1□□□□□ -2.75
TCOF1Q13428 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
TCOF1Q13428 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
TCOF1Q13428 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
TCOF1Q13428 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
TCOF1Q13428 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
TCOF1Q13428 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
TCOF1Q13428 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
TCOF1Q13428 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
TCOF1Q13428 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
TCOF1Q13428 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
TCOF1Q13428 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
TCOF1Q13428 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
TCOF1Q13428 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
TCOF1Q13428 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
TCOF1Q13428 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
TCOF1Q13428 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
TCOF1Q13428 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
TCOF1Q13428 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
TCOF1Q13428 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
TCOF1Q13428 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
TCOF1Q13428 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
TCOF1Q13428 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC-2.14□□□□□ -2.75
TCOF1Q13428 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
TCOF1Q13428 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
TCOF1Q13428 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
TCOF1Q13428 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
TCOF1Q13428 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
TCOF1Q13428 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
TCOF1Q13428 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
TCOF1Q13428 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
TCOF1Q13428 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
TCOF1Q13428 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
TCOF1Q13428 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
TCOF1Q13428 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
TCOF1Q13428 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
TCOF1Q13428 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
TCOF1Q13428 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
TCOF1Q13428 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
TCOF1Q13428 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
TCOF1Q13428 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
TCOF1Q13428 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
TCOF1Q13428 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC-2.16□□□□□ -2.76
TCOF1Q13428 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
TCOF1Q13428 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
TCOF1Q13428 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
TCOF1Q13428 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
TCOF1Q13428 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
TCOF1Q13428 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
TCOF1Q13428 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
TCOF1Q13428 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
TCOF1Q13428 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
TCOF1Q13428 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
TCOF1Q13428 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
TCOF1Q13428 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
TCOF1Q13428 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
TCOF1Q13428 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
TCOF1Q13428 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
TCOF1Q13428 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
TCOF1Q13428 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
TCOF1Q13428 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
TCOF1Q13428 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
TCOF1Q13428 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
TCOF1Q13428 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
TCOF1Q13428 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
TCOF1Q13428 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
TCOF1Q13428 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
TCOF1Q13428 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
TCOF1Q13428 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
TCOF1Q13428 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
TCOF1Q13428 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
TCOF1Q13428 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
TCOF1Q13428 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
TCOF1Q13428 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
TCOF1Q13428 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
TCOF1Q13428 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
TCOF1Q13428 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
TCOF1Q13428 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
TCOF1Q13428 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
TCOF1Q13428 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC-2.21□□□□□ -2.76
TCOF1Q13428 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
TCOF1Q13428 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
TCOF1Q13428 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
TCOF1Q13428 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
TCOF1Q13428 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
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