Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-892P-201ENST00000410335 99 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1091P-201ENST00000363945 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
KRTAP9-3Q9BYQ3 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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