Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USP43Q70EL4 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USP43Q70EL4 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USP43Q70EL4 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USP43Q70EL4 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USP43Q70EL4 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
USP43Q70EL4 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP43Q70EL4 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
USP43Q70EL4 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP43Q70EL4 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP43Q70EL4 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP43Q70EL4 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP43Q70EL4 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
USP43Q70EL4 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP43Q70EL4 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP43Q70EL4 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP43Q70EL4 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
USP43Q70EL4 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
USP43Q70EL4 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USP43Q70EL4 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USP43Q70EL4 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USP43Q70EL4 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USP43Q70EL4 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
USP43Q70EL4 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
USP43Q70EL4 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USP43Q70EL4 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USP43Q70EL4 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USP43Q70EL4 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USP43Q70EL4 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USP43Q70EL4 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USP43Q70EL4 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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