Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 PPFIBP1-202ENST00000318304 6001 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 MIAT_exon5_1.1-201ENST00000618919 149 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
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KRTAP9-9Q9BYP9 MIR6127-201ENST00000614019 109 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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KRTAP9-9Q9BYP9 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
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KRTAP9-9Q9BYP9 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 GOLGB1-209ENST00000614479 11115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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