Protein–RNA interactions for Protein: Q16558

KCNMB1, Calcium-activated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB1Q16558 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KCNMB1Q16558 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KCNMB1Q16558 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KCNMB1Q16558 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KCNMB1Q16558 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KCNMB1Q16558 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KCNMB1Q16558 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KCNMB1Q16558 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KCNMB1Q16558 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KCNMB1Q16558 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KCNMB1Q16558 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KCNMB1Q16558 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KCNMB1Q16558 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KCNMB1Q16558 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KCNMB1Q16558 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KCNMB1Q16558 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KCNMB1Q16558 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KCNMB1Q16558 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KCNMB1Q16558 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KCNMB1Q16558 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KCNMB1Q16558 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KCNMB1Q16558 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KCNMB1Q16558 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KCNMB1Q16558 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KCNMB1Q16558 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KCNMB1Q16558 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KCNMB1Q16558 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KCNMB1Q16558 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KCNMB1Q16558 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KCNMB1Q16558 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KCNMB1Q16558 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KCNMB1Q16558 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KCNMB1Q16558 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KCNMB1Q16558 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KCNMB1Q16558 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KCNMB1Q16558 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KCNMB1Q16558 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KCNMB1Q16558 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KCNMB1Q16558 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KCNMB1Q16558 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KCNMB1Q16558 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KCNMB1Q16558 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KCNMB1Q16558 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KCNMB1Q16558 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
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KCNMB1Q16558 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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KCNMB1Q16558 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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KCNMB1Q16558 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
KCNMB1Q16558 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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KCNMB1Q16558 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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KCNMB1Q16558 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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KCNMB1Q16558 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KCNMB1Q16558 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KCNMB1Q16558 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KCNMB1Q16558 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KCNMB1Q16558 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KCNMB1Q16558 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KCNMB1Q16558 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KCNMB1Q16558 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KCNMB1Q16558 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KCNMB1Q16558 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KCNMB1Q16558 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KCNMB1Q16558 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
KCNMB1Q16558 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KCNMB1Q16558 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KCNMB1Q16558 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KCNMB1Q16558 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KCNMB1Q16558 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KCNMB1Q16558 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KCNMB1Q16558 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KCNMB1Q16558 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KCNMB1Q16558 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KCNMB1Q16558 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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