Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SOBPA7XYQ1 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
SOBPA7XYQ1 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SOBPA7XYQ1 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.3 ms